Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8888J3QPX5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8888J3QPX5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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