Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm29394H3BIW7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms