Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm8220F6YKI2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms