Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igkv1-99F6XWB2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igkv1-99F6XWB2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms