Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf4E9QAP7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf4E9QAP7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms