Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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