Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc146E9Q9F7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc146E9Q9F7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms