Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ythdc1E9Q5K9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms