Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp558E9Q1J0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Zfp558E9Q1J0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Zfp558E9Q1J0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp558E9Q1J0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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