Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Krt78E9Q0F0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt78E9Q0F0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms