Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl3lE9PWZ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl3lE9PWZ3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms