Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CatipB9EKE5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CatipB9EKE5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms