Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cttnbp2B9EJA2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cttnbp2B9EJA2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cttnbp2B9EJA2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms