Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms