Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M5A7VMS3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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