Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samt1A2BED8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samt1A2BED8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samt1A2BED8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms