Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam205aA2APU8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam205aA2APU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms