Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Calcoco2A2A6M5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Calcoco2A2A6M5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms