Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv26A0A0B4J1P5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv26A0A0B4J1P5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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