Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms