Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trbc2A0A075B5J4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbc2A0A075B5J4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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