Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm25837-201ENSMUST00000158919 108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Olfr806-203ENSMUST00000215142 3108 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ttc5-202ENSMUST00000226768 2366 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Babam2-203ENSMUST00000114507 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 Tctex1d1-206ENSMUST00000169211 1000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ube3bQ9ES34 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm16465-201ENSMUST00000118585 1758 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Tyrp1-202ENSMUST00000102831 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm15577-201ENSMUST00000144350 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Fam50a-201ENSMUST00000114160 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube3bQ9ES34 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms