Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4930534H03Rik-201ENSMUST00000216311 1669 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Baalc-201ENSMUST00000163313 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atg3Q9CPX6 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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