Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
OtofQ9ESF1 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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