Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrit3W8DXL4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrit3W8DXL4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms