Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Speer3W4VSP1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Speer3W4VSP1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms