Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Homer1Q9Z2Y3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms