Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf394Q9Z1D9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf394Q9Z1D9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms