Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4s1Q9WVL1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms