Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp46a1Q9WVK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms