Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Carm1Q9WVG6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Carm1Q9WVG6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Carm1Q9WVG6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Carm1Q9WVG6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms