Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn3Q9WUK7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn3Q9WUK7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms