Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptpn4Q9WU22 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn4Q9WU22 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms