Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psma4Q9R1P0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms