Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Foxe3Q9QY14 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Foxe3Q9QY14 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Foxe3Q9QY14 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms