Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChmQ9QXG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChmQ9QXG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms