Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms