Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms