Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr5Q9JLF7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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