Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pole3Q9JKP7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms