Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem47Q9JJG6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem47Q9JJG6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms