Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms