Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RprmQ9JJ72 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RprmQ9JJ72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms