Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip1Q9JJ57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip1Q9JJ57 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms