Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc12a4Q9JIS8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc12a4Q9JIS8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms