Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dap3Q9ER88 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms