Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sall1Q9ER74 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sall1Q9ER74 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sall1Q9ER74 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms