Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r47Q9EQ51 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r47Q9EQ51 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms