Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r171Q9EPS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r171Q9EPS6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms