Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpr88Q9EPB7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms